Modules

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      • hatchet.bin.HATCHet module
      • hatchet.bin.HATCHet-preprocess module
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    • hatchet.data package
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    • hatchet.utils package
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      • hatchet.utils.ArgParsing module
      • hatchet.utils.BAMBinning module
      • hatchet.utils.CoordinateFinding module
      • hatchet.utils.ProgressBar module
      • hatchet.utils.Supporting module
      • hatchet.utils.TotalCounting module
      • hatchet.utils.check module
      • hatchet.utils.check_solver module
      • hatchet.utils.cluster_bins module
      • hatchet.utils.cluster_bins_gmm module
      • hatchet.utils.combine_counts module
      • hatchet.utils.combine_counts_fw module
      • hatchet.utils.commands module
      • hatchet.utils.config module
      • hatchet.utils.count_alleles module
      • hatchet.utils.count_reads module
      • hatchet.utils.count_reads_fw module
      • hatchet.utils.download_panel module
      • hatchet.utils.genotype_snps module
      • hatchet.utils.multiprocessing module
      • hatchet.utils.phase_snps module
      • hatchet.utils.plot_bins module
      • hatchet.utils.plot_bins_1d2d module
      • hatchet.utils.plot_cn module
      • hatchet.utils.plot_cn_1d2d module
      • hatchet.utils.rd_gccorrect module
      • hatchet.utils.run module
      • Module contents
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